三亚珊瑚礁自然保护区属于三亚市沿海区，以鹿回头、大东海海域为主，包括亚龙湾、野猪岛海域，以及三亚湾东西玳瑁岛海域，总面积40平方公里，保护对象为珊瑚礁及其生态系统。

保护区水质良好，海水透明度大，水下80多种珊瑚礁群A发育良好，并栖息有多种鱼虾、贝、藻和其他门类的海洋生物，属典型的岸礁生态系统。珊瑚礁是热带海洋重要的生态防波堤坝，具有重要的经济价值和旅游价值。

我国海南岛三亚珊瑚礁自然保护区附近海域，生长着大片美丽的珊瑚礁，吸引着大批中外游人。1989年，许多科学家提议将这片珊瑚礁海域划为国家级海洋自然保护区。1990年9月，国务院经征求各方面意见，批准由国家海洋局建设并负责管理这个国家级珊瑚礁海洋自然保护区。

三亚珊瑚礁自然保护区是海南省第三个国家级海洋自然保护区，位于三亚市鹿回头半岛沿岸、东西瑁洲、牙龙湾海域，海陆总面积为85平方千米，其保护对象为珊瑚礁构成的典型的热带海洋生态系统与海洋生物物种。保护区内生产力很高，生物资源丰富，是保护海洋生物多样性的重要海区。区内根据自然保护的需要，划分为核心区、缓冲区和试验区。对核心区内的珊瑚礁资源采取绝对保护措施。

三亚珊瑚礁自然保护区是一种经济价值和生态价值都很高的海洋腔肠类动物。三亚沿岸自然环境良好，很适宜珊瑚的生长繁殖。在漫长的地质年代，多种珊瑚在这里不断繁衍，形成了大片珊瑚礁。据调查证实，鹿回头、牙龙湾、东西瑁洲等区分布着80多种造礁珊瑚，礁群发育良好，珊瑚的种类和数量在中国近海均占领先地位。珊瑚在生长进化的过程中，形成了各种各要的珊瑚礁，并栖息着多种鱼、虾、贝、藻和其他门类的海洋生物，构成了美丽的水下景观。但是，在70年代和80年代，珊瑚礁受到了严重的破坏，人们采挖珊瑚礁制作工艺品，甚至用珊瑚礁烧制石灰，使这一带的珊瑚礁资源大量减少，良好的生态环境遭到破坏，生物多样性遭受损害。为了保护这一珍贵的海洋生物资源及其相关的生态环境，保护海洋生物的多样性，为子孙后代造福，必须采取有效的保护措施。建立自然保护区正是为了这个目的。